К ато неин председател Херцел ръководи още шест конгреса между 1897 и 1903 г,, преди да почине от пневмония.
През годините до края на живота си той се среща с мнозина световни лидери, като лобира за политическа и финансова подкрепа за "големия проект".
Тленните останки на Теодор Херцел, починал в Австрия на 44 години, бяха пренесени в Йерусалим още след създаването на Израел през 1949 г.