Междувременно профсъюзът на немските пилоти "Кокпит" обвини руските пилоти, че не е трябвало да следват съветите на диспечера, а указанията на автоматичната система за предотвратяване на сблъсък.
"Сигналът от автоматиката е главният за екипажа", обясняват немските пилоти. Според международните стандарти пилотите трябва да спазват указанията на бордовата система дори в случай, че те противоречат на разпорежданията на диспечерите. Показанията на уредите се игнорират само в случай, че пилотът е установил визуален контакт с приближаващ се самолет и вижда, че електрониката дава неверни препоръки.
Едновременно с това, председателят на съюза на немските пилоти Георг Фонгерн е изразил възмущение от драстичната небрежност на сътрудниците на швейцарската диспечерска служба, съобщи ИТАР-ТАСС. Фонгерн оценил като напълно недопустима ситуацията, в която през нощта срещу 2 юли в центъра за управление на полетите в Цюрих са били изключени много от важните системи, а единствената телефонна линия не е функционирала. Така немският център за въздушен контрол в Карлсруе не е успял да предупреди швейцарските си колеги, въпреки че е регистрирал опасното приближаване във въздуха.