Н а 5 август 2003 г. в Хасковския районен съд беше внесен Обвинителен акт срещу Иван Тодоров и му беше наложена
формална забрана да напуска страната
заради старо дело за грабеж и отвличане на бизнесмена Милослав Кръстев, извършено на 2 април 1994 г. Доктора обаче беше в чужбина по онова време.
Разбра се, че Милослав Кръстев бил замесен в нелегален внос на цигари от Турция през 1996 г. Преди това, през 1994 г. бил отвлечен и държан няколко дни във фамилната къща на Иван Тодоров в село Марково и му отнели луксозен автомобил и 68 000 долара.
На 15 август 2003 г. Доктора пристигна с частен самолет от Милано, кацна в Пловдив, яви се пред Окръжната следствена служба на Хасково и веднага пак се върна в Италия. По време на двучасовия разпит заявил, че се страхува от нов атентат. Поведението му беше демонстративно арогантно, никой не се опита да го спре, той не даде никакви изявления пред медиите.
Делото беше насрочено за 20 ноември 2003. На 16 ноември международният паспорт на Иван Тодоров - Доктора беше отнет при влизането му в България през ГКПП - Златарево.
На делото Милослав Кръстев неочаквано заяви, че не е сигурен, че Иван Тодоров е бил сред мъжете, които са го отвлекли.
На другия ден Окръжният съд отмени решението, с което на Тодоров се забранява да напуска страната, и постанови, че той може да се лекува в чужбина, но трябва да се завърне не по-късно от 24 февруари 2004 г.
Междувременно, на 5 декември 2003 г. на улицата в центъра на Амстердам
беше застрелян Константин Димитров-Самоковеца
- другият, наред с Доктора, голям бос на контрабандния бизнес в България, според слуховете и много публикации в медиите.
Доктора се яви на 26 февруари 2004 г. След поредица отлагания и заседания Тодоров беше осъден от Хасковския окръжен съд на 5 години затвор. Обвиняваният за контрабанда на цигари бизнесмен получи присъда за старо дело за рекет и въоръжен грабеж.
Започва нова фаза на разтакаването на делото в съда, чрез обжавлания и безконечни отлагания по една или друга причина.
На 21 Декември 2004 г. на Доктора и на Милослав Кръстев беше наложена мярка за неотклонение подписка заради лъжесвидетелстване, подбуждане към лъжесвидетелстване и клевета.
Ново обвинение, този път за пране на пари, придобити от контрабанда на цигари, повдигна към Доктора Националната следствена служба на 17 февруари 2005 г.
Обвинени бяха и бившите му съдружници Петър Петров-Амигото и братята Дойчин и Димитър Мирянови. Доктора беше
уличен в контрабанда на цигари за 50 милиона евро.
Трафикът е бил насочен към Македония, затова в България не било възможно Доктора да бъде съден за контрабанда.
Обвиненията били само за пране на пари, придобити от контрабандата. Внасял парите в български банки и с фалшиви търговски договори ги разпращал в трезори по цял свят.
На Иван Тодоров отново беше наложена забрана да напуска страната и парична гаранция 15 000 лв. На 21 февруари 2005 г. Софийският градски съд му наложи и постоянна мярка за неотклонение задържане под стража.
На 23 февруари 2005 г. македонският вестник "Време " писа за връзки на Доктора с хора от бившето правителство на Георгиевски по линия на контрабандата с цигари в Република Македония. Люпчо Георгиевски опровергава твърденията.
На 18 октомври 2005 г. в Софийския градски съд започна новото дело. Обвиняеми този път бяха Иван Тодоров-Доктора, Петър Петров-Пепи Амигоса, братята Дойчин и Димитър Мирянови и Цвета Манавска за изпирането на 99 млн. лв., придобити от престъпна дейност.
На 31 октомври 2005 г. бяха задържани и още са в ареста братята Красимир и Николай Маринови - Големия и Малкия Маргин, защото готвели убийството на Доктора, на някогашния генерал от Държавна сигурност, бивш вътрешен и външен министър Любен Гоцев и на финансиста Никола Дамянов.
На 1 февруари 2006 г. Доктора се яви в съда на заседание, за което предварително беше ясно, че ще бъде отложено. Той отказа да коментира пред репортерите какви биха могли да бъдат мотивите на братята Маринови да искат смъртта му. Ново заседание беше насрочено за 13 март.
На
въпросите, които се оказаха последните в живота му:
Познавате ли Маргините, защо биха искали смъртта ви, каква е връзката между вас, Любен Гоцев и Никола Дамянов, страхувате ли се за живота си? - Доктора отговори само с: "Няма да отговарям на никакви въпроси, трудно чувам. Ще говорим по-късно. Вие знаете по-добре."
Иван Тодоров-Доктора e роден на 27 декември 1964 г. в Димитровград. В обвинителни актове пише, че "произхожда от семейство на работници, има средно образование, учил е медицина, но не се е дипломирал, женен е, не е осъждан, не се ползва с добро име, тъй като се счита, че се занимава с незаконен бизнес в страната и чужбина".
Твърдеше, че няма фирми на територията на страната. Според регистрите обаче той все още участва в "Източни финанси" и "Скузи-2-Тодоров и с-ие"-Димитровград с предмет на дейност търговско посредничество. Съдружници са бившата му съпруга Вилиана (с която е разведен) и Моника Манолова.
