Краузе бе обвинен и в опит за укриване на данъци. Между 1993 и 1995 г. той не деларирал доходи на стойност 360 000 евро и предоставил неверни данни за финансовото си състояние при парламентарните избори през 1998 г.
Бш шият германски министър на транспорта Гюнтер Краузе бе осъден на три години и девет месеца затвор за измама, злоупотреба и опит за укриване на данъци. Съдиите решиха, че бившият министър от кабинета на Хелмут Кол е виновен за загубата на 6 млн. евро, получени като заем от компанията му "Ауфбау Инвест" в средата на 90-те години. Краузе обявил, че ще вложи парите в строеж на жилища, но вместо това без знанието на съдружниците си използвал заема за неуспешни обменни сделки чрез швейцарска фирма.