Първият взрив е избухнал в отделението за багаж на 3-етажен търговски център, а вторият няколко минути по-късно в съседен магазин за хранителни стоки. Трета бомба е намерена наблизо и е обезвредена, предаде АП. Полицаи с кучета са претърсили района за още експлозиви. Свидетели твърдят, че видели мъж, който излязал малко преди взрива от центъра и оставил някакъв пакет отпред, като след това се отдалечил бързо.
Атентатът е станал няколко часа след назначаването на новия военнокомандващ за региона, който обещал да унищожи терористичната организация "Абу Саяф". Групата действа от няколко години в южната част на страната. Град Замбоанга е населен предимно с хритияни, въпреки че населението изповядва основно мюсюлманската религия.
Засега никоя организация не е поела отговорността за инцидента. Местната полиция предполага, че той е акт на ислямистка радикална групировка, която от много години води партизанска война срещу правителството и се опитва да преобразува Филипините в ислямска държава.
Акцията в Замбоанга е била осъществена въпреки усилените мерки за сигурност, въведени в страната след терористичните актове на индонезийския остров Бали.